-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 3
/
grabit.m
2067 lines (1804 loc) · 89 KB
/
grabit.m
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
function grabit(fname)
%GRABIT Extracts data points from an image file.
%
% GRABIT starts a GUI program for extracting data from an image file.
% It is capable of reading in BMP, JPG, TIF, GIF, and PNG files (anything
% that is readable by IMREAD). Multiple data sets can be extracted from a
% single image file, and the data is saved as an n-by-2 matrix variable in
% the workspace. It can also be renamed and saved as a MAT file.
%
% Following steps should be taken:
% 1. Load the image file.
% 2. Calibrate axes dimensions. You will be prompted to select 4 points
% on the image. Zoom and pan enabled.
% 3. Grab points by clicking on points. Right-click to delete a point.
% Image can be zoomed and panned.
% 4. Multiple data sets will remain in memory so long as the GUI is open.
% Variables can be renamed, saved to file, or edited in Array Editor.
%
% Panning is achieved by clicking and dragging on the image. Double-click
% to center view. Right click and drag to zoom in and out. In addition,
% there are keyboard shortcuts for zooming:
% <a> - zoom in
% <b> - zoom out
% <space> - reset view
%
% This code will also work for extracting data points from a tilted or a
% skewed image (even upside-down or mirrored). The calibration stage
% ensures that the imperfect orientation or quality of the image is
% accounted for.
%
% The types of files that will most likely work are BMP, JPG, TIF, GIF (up
% to 8-bit), and PNG files. Basically, any format supported by the IMREAD
% is accepted.
%
% GRABIT(FILENAME) will start the GUI program and open the image file
% FILENAME.
%
% Type GRABIT('-sample') to load a sample image.
%
%
% VERSIONS:
% v1.0 - first version
% v1.1 - use imshow instead of image (takes care of colormap)
% v1.5 - convert to a GUI version
% v1.6 - added functionality to open a file from the command window and
% embedded a sample image file to the function
% v1.6.1 - changed cross cursor to crosshair
% v1.6.2 - brought back 'image' in case the user doesn't have Image Toolbox
% v1.6.5 - fixed zoom problem in R14
% v2.0 - major code change. added zoom feature during calibration. added
% panning feature. (March 3, 2006)
% v2.1 - store sample image as HEX to reduce file size. (March 6, 2006)
% v2.1.1 - animate view change and zooming for a better visual perception
% (March 11, 2006)
% v2.1.5 - added features: double-click to center view. right-click and
% drag to zoom. other minor code changes. (March 16, 2006)
% v2.2 - fixed loadImageFcn bug. (May 4, 2006)
% v2.3 - fixed bug to work with grayscale image (Jan, 2007)
%
% Created in Matlab R13. Tested up to R2006b
%
% Copyright 2003
% Jiro Doke
%
% To Do: Capability to deal with logarithmic axes
%
%--------------------------------------------------------------------------
% Initialize
%--------------------------------------------------------------------------
sh = get(0, 'ShowHiddenHandles');
set(0, 'ShowHiddenHandles', 'on');
% close existing windows
im = findobj('type', 'figure', 'tag', 'GrabitGUI');
if ishandle(im)
close(im);
end
set(0, 'ShowHiddenHandles', sh);
% background colors
bgcolor1 = [.8, .8, .8];
bgcolor2 = [ 1, 1, 1];
bgcolor3 = [.7, .7, .7];
bgcolor4 = [ 1, .5, .5];
%--------------------------------------------------------------------------
% Custom cursor pointers
%--------------------------------------------------------------------------
zoomPointer = [
2 2 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 1 1 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 NaN NaN NaN NaN 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 NaN NaN 2 2 1 1 1 1 2 2 NaN NaN NaN
2 1 2 NaN 2 1 1 2 2 2 2 1 1 2 NaN NaN
NaN 2 NaN NaN 2 1 2 2 1 1 2 2 1 2 NaN NaN
NaN NaN NaN 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 NaN
NaN NaN NaN 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 NaN
NaN NaN NaN 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 NaN
NaN NaN NaN 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 NaN
NaN NaN NaN NaN 2 1 2 2 1 1 2 2 1 2 NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 2 1 1 2 2 2 2 1 1 1 2 NaN
NaN NaN NaN NaN NaN 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 2
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2 2 2 2 NaN 2 1 1 1
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 2 1 2
];
zoomInOutPointer = [
NaN NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN
NaN NaN 2 1 1 2 NaN NaN NaN NaN 1 2 2 2 1 NaN
NaN 2 1 1 1 1 2 NaN NaN 1 2 2 1 2 2 1
2 1 1 1 1 1 1 2 NaN 1 2 1 1 1 2 1
2 1 2 1 1 2 1 2 NaN 1 2 2 1 2 2 1
NaN 2 2 1 1 2 2 NaN NaN 1 1 2 2 2 1 NaN
NaN NaN 2 1 1 2 NaN NaN 1 1 1 1 1 1 NaN NaN
NaN NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN
NaN NaN 2 1 1 2 NaN NaN NaN NaN 1 2 2 2 1 NaN
NaN 2 2 1 1 2 2 NaN NaN 1 2 2 2 2 2 1
2 1 2 1 1 2 1 2 NaN 1 2 1 1 1 2 1
2 1 1 1 1 1 1 2 NaN 1 2 2 2 2 2 1
NaN 2 1 1 1 1 2 NaN NaN 1 1 2 2 2 1 NaN
NaN NaN 2 1 1 2 NaN NaN 1 1 1 1 1 1 NaN NaN
NaN NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
];
% closed hand pointer (from Jérôme Briot)
closedHandPointer = [
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 2 2 NaN 2 2 NaN 2 2 NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 NaN NaN
NaN NaN 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 NaN
NaN NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2
NaN NaN NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2
NaN NaN 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2
NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2
NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2
NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 NaN
NaN NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 NaN
NaN NaN NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 NaN NaN
];
% X-axis Origin pointer
xoPointer = [
2 2 2 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 1 1 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 NaN 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 2 2 NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN
NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN 1 1 1 NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN 1 1 NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN
];
% X-axis Max pointer
xmPointer = [
2 2 2 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 1 1 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 NaN 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 2 2 NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 NaN NaN 1 1 NaN 1 1
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN 1 1 1 NaN 1 NaN 1 NaN 1
NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN 1 1 NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
];
% Y-axis Origin pointer
yoPointer = [
2 2 2 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 1 1 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 NaN 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 2 2 NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 NaN NaN NaN 1 1 1 NaN
NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 NaN NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN
];
% Y-axis Max pointer
ymPointer = [
2 2 2 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 1 1 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 1 2 2 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 1 2 NaN 2 1 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 2 2 NaN NaN 2 2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 1 NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN NaN 1 1 NaN 1 1
NaN NaN NaN 1 1 1 1 1 NaN NaN NaN 1 NaN 1 NaN 1
NaN NaN NaN 1 1 1 NaN NaN NaN NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1 NaN NaN NaN 1
];
% zoom button icon
zoomIcon = [
1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1
1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1
1 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1
1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1
1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1
0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1
0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1
0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1
0 0 1 1 1 1 0 0 1 1 1 1 0 0 1 1
1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1
1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1 0 0 1 1 1
1 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 1
1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1
1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0
1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0
1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0
];
% create zoom icon (RGB matrix)
fgID = zoomIcon==0;
bgID = ~fgID;
zI1 = zeros([size(zoomIcon), 3]);
zI2 = zeros([size(zoomIcon), 3]);
for id = 1:3
tmp = zoomIcon;
tmp(fgID) = 0;
tmp(bgID) = bgcolor3(id);
zI1(:,:,id) = tmp;
tmp(bgID) = bgcolor4(id);
zI2(:,:,id) = tmp;
end
% get screen size in pixels
un = get(0, 'units');
set(0, 'units', 'pixels');
screenSize = get(0, 'ScreenSize');
sW = screenSize(3);
sH = screenSize(4);
set(0, 'units', un);
% figure width and height (in pixels)
fW = sW-200;
fH = sH-100;
im = figure(...
'units' , 'pixels', ...
'position' , [100, 50, fW, fH], ...
'backingstore' , 'off', ...
'doublebuffer' , 'on', ...
'name' , 'Grabit', ...
'numbertitle' , 'off', ...
'menubar' , 'none', ...
'color' , bgcolor1, ...
'pointer' , 'arrow', ...
'visible' , 'off', ...
'interruptible' , 'off', ...
'busyaction' , 'cancel', ...
'resizefcn' , @figResizeFcn, ...
'windowbuttonupfcn' , @winBtnUpFcn, ...
'keypressfcn' , @keyPressFcn, ...
'deletefcn' , 'delete(timerfind(''name'', ''BtnUpTimer''));', ...
'tag' , 'GrabitGUI', ...
'defaultUicontrolUnits' , 'pixels', ...
'defaultUicontrolBackgroundColor' , bgcolor3, ...
'defaultUicontrolFontname' , 'Verdana', ...
'defaultUicontrolFontUnits' , 'pixels', ...
'defaultUicontrolFontsize' , 10, ...
'defaultUicontrolInterruptible' , 'off', ...
'defaultUicontrolBusyAction' , 'cancel', ...
'defaultAxesFontName' , 'Verdana', ...
'defaultAxesUnits' , 'pixels', ...
'defaultAxesFontSize' , 8);
panelW = 0.8*fW;
uicontrol(...
'style' , 'frame', ...
'position' , [10, fH-110, panelW, 100], ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'pushbutton', ...
'string' , 'Load Image...', ...
'callback' , {@loadImageFcn, []}, ...
'position' , [15, fH-40, 200, 25], ...
'tag' , 'LoadImageBtn');
uicontrol(...
'style' , 'edit', ...
'backgroundcolor' , bgcolor2, ...
'string' , '', ...
'position' , [220, fH-40, panelW-215, 25], ...
'horizontalalignment' , 'left', ...
'enable' , 'inactive', ...
'tag' , 'ImageFileLoc');
uicontrol(...
'style' , 'frame', ...
'position' , [15, fH-75, 3*(panelW-20)/4-5, 30], ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'togglebutton', ...
'string' , 'Calibrate', ...
'buttondownfcn' , @calibrateImageFcn, ...
'position' , [20, fH-72, panelW/4-25, 25], ...
'enable' , 'off', ...
'tag' , 'CalibrateImageBtn');
calibFrameX = panelW/4-5;
calibFrameW = panelW/2-10;
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , 'Xo:', ...
'fontweight' , 'bold', ...
'horizontalalignment' , 'right', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nX-Axis Origin'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5+calibFrameW/8, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , ' NaN', ...
'horizontalalignment' , 'left', ...
'tag' , 'hXoValue', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nX-Axis Origin'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5+calibFrameW/4, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , 'Xm:', ...
'fontweight' , 'bold', ...
'horizontalalignment' , 'right', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nX-Axis Max'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5+3*calibFrameW/8, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , ' NaN', ...
'horizontalalignment' , 'left', ...
'tag' , 'hXmValue', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nX-Axis Max'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5+calibFrameW/2, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , 'Yo:', ...
'fontweight' , 'bold', ...
'horizontalalignment' , 'right', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nY-Axis Origin'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5+5*calibFrameW/8, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , ' NaN', ...
'horizontalalignment' , 'left', ...
'tag' , 'hYoValue', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nY-Axis Origin'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5+3*calibFrameW/4, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , 'Ym:', ...
'fontweight' , 'bold', ...
'horizontalalignment' , 'right', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nY-Axis Max'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [calibFrameX+5+7*calibFrameW/8, fH-70, calibFrameW/8, 15], ...
'string' , ' NaN', ...
'horizontalalignment' , 'left', ...
'tag' , 'hYmValue', ...
'tooltipstring' , sprintf('Calibration:\nY-Axis Max'), ...
'backgroundcolor' , bgcolor2);
uicontrol(...
'style' , 'togglebutton', ...
'string' , 'Grab Points', ...
'buttondownfcn' , @grabPointsFcn, ...
'position' , [3*(panelW)/4, fH-72, panelW/4+5, 25], ...
'enable' , 'off', ...
'tag' , 'GrabPointsBtn');
uicontrol(...
'style' , 'togglebutton', ...
'cdata' , zI1, ...
'buttondownfcn' , @zoomBtnFcn, ...
'position' , [15, fH-105, 25, 25], ...
'enable' , 'inactive', ...
'tag' , 'ZoomStateBtn');
uicontrol(...
'style' , 'pushbutton', ...
'string' , 'Reset View ', ...
'callback' , @resetViewFcn, ...
'position' , [45, fH-105, 100, 25], ...
'tag' , 'ResetViewBtn');
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'position' , [150, fH-108, panelW-145, 31], ...
'horizontalalignment' , 'center', ...
'foregroundcolor' , [0 0 .5], ...
'backgroundcolor' , bgcolor2, ...
'fontsize' , 10, ...
'string' , {'Click and drag to pan. Double-click to center. Right-click and drag to zoom.', ...
'Keyboard Shortcuts: <a> - zoom in, <z> - zoom out, <space> - reset view'});
rPanelX = 0.82 * fW;
rPanelW = fW - rPanelX - 10;
uicontrol(...
'style' , 'listbox', ...
'callback' , @selectVariableFcn, ...
'position' , [rPanelX+10, 100, rPanelW-20, 0.6*fH], ...
'backgroundcolor' , bgcolor2, ...
'tooltipstring' , sprintf('Double-click to edit\nvariable in Array Editor'), ...
'tag' , 'VariableList');
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'string' , 'Data in Memory', ...
'position' , [rPanelX+10, 0.6*fH+100, rPanelW-20, 20], ...
'backgroundcolor' , bgcolor1, ...
'fontweight' , 'bold');
uicontrol(...
'style' , 'pushbutton', ...
'string' , 'Save to file as...', ...
'position' , [rPanelX+10, 70, rPanelW-20, 25], ...
'callback' , @variableManipulationFcn, ...
'tooltipstring' , sprintf('Save variable as a MAT file or\nDouble-precision, tab-delimited TXT file'), ...
'tag' , 'SaveAs');
uicontrol(...
'style' , 'pushbutton', ...
'string' , 'Rename...', ...
'position' , [rPanelX+10, 45, rPanelW-20, 25], ...
'callback' , @variableManipulationFcn, ...
'tooltipstring' , 'Rename variable in workspace', ...
'tag' , 'Rename');
uicontrol(...
'style' , 'pushbutton', ...
'string' , 'Delete...', ...
'position' , [rPanelX+10, 20, rPanelW-20, 25], ...
'callback' , @variableManipulationFcn, ...
'tooltipstring' , 'Delete variable from workspace', ...
'tag' , 'Delete');
axes(...
'position' , [10, 10, 0.8*fW, fH-200], ...
'visible' , 'on', ...
'handlevisibility' , 'on', ...
'box' , 'on', ...
'drawmode' , 'fast', ...
'xtick' , [], ...
'ytick' , [], ...
'interruptible' , 'off', ...
'buttondownfcn' , @winBtnDownFcn, ...
'tag' , 'ImageAxis');
imAxRatio = (fH - 200) / (0.8 * fW);
title('', 'fontunits', 'pixels', 'fontsize', 24, 'color', 'red');
axes(...
'position' , [rPanelX+20, 0.6*fH+150, rPanelW-30, 0.4*fH-190], ...
'box' , 'on', ...
'tag' , 'PreviewAxis');
uicontrol(...
'style' , 'text', ...
'string' , 'Preview Box', ...
'fontweight' , 'bold', ...
'position' , [rPanelX+20, fH-40, rPanelW-30, 25], ...
'backgroundcolor' , bgcolor1);
uicontrol(...
'style' , 'edit', ...
'backgroundcolor' , bgcolor4, ...
'string' , 'Enter Value', ...
'position' , [0 0 100 25], ...
'horizontalalignment' , 'left', ...
'visible' , 'off', ...
'callback' , @coordinateEditFcn, ...
'tag' , 'CoordinateEdit');
set(findobj(im, 'type', 'uicontrol'), 'units', 'normalized');
set(findobj(im, 'type', 'axes'), 'units', 'normalized');
% create handles structure
handles = guihandles(im);
handles.zoomPointer = zoomPointer;
handles.zoomPointerHotSpot = [2 2];
handles.zoomInOutPointer = zoomInOutPointer;
handles.zoomInOutPointerHotSpot = [9 9];
handles.closedHandPointer = closedHandPointer;
handles.closedHandPointerHotSpot = [9 9];
handles.xoPointer = xoPointer;
handles.xoPointerHotSpot = [2 2];
handles.xmPointer = xmPointer;
handles.xmPointerHotSpot = [2 2];
handles.yoPointer = yoPointer;
handles.yoPointerHotSpot = [2 2];
handles.ymPointer = ymPointer;
handles.ymPointerHotSpot = [2 2];
handles.zoomIconUp = zI1;
handles.zoomIconDown = zI2;
handles.curPointer = 'arrow';
handles.curPointerData.CData = zoomPointer;
handles.curPointerData.HotSpot = [1 1];
handles.state = 'normal';
handles.bgcolor1 = bgcolor1;
handles.bgcolor2 = bgcolor2;
handles.bgcolor3 = bgcolor3;
handles.bgcolor4 = bgcolor4;
handles.imAxRatio = imAxRatio;
handles.I = [];
handles.map = [];
handles.savedVars = struct;
handles.isPanning = false;
handles.curTitle = '';
handles.CurrentPointAxes = [];
handles.CurrentPointFig = [];
handles.timer = timer(...
'Name', 'BtnUpTimer', ...
'StartDelay', 0.2, ...
'TimerFcn', {@btnUpTimerFcn, im});
guidata(im, handles);
set(im, 'handlevisibility', 'callback');
if nargin == 1 && ischar(fname)
switch lower(fname)
case '-sample'
fname = createSampleImageFcn;
if ~isempty(fname)
loadImageFcn(handles.LoadImageBtn, [], fname);
try
pause(0.5);
delete(fname);
catch
errordlg(lasterr);
end
end
otherwise
filename = which(fname);
if ~isempty(filename)
loadImageFcn(handles.LoadImageBtn, [], filename);
else
errordlg(sprintf('%s\nnot found.', fname));
return;
end
end
end
set(im, 'visible', 'on');
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
% variableManipulationFcn
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
function variableManipulationFcn(varargin)
% This callback is called when one of the three buttons under the variable
% listbox is pressed.
obj = varargin{1};
handles = guidata(obj);
vars = fieldnames(handles.savedVars);
if isempty(vars)
return;
end
listboxVal = get(handles.VariableList, 'value');
varName = vars{listboxVal};
switch get(obj, 'Tag')
case 'SaveAs' % save the variable as a .mat file
[fname, pname] = uiputfile(...
{'*.mat', 'MAT files (*.mat)'; ...
'*.txt', 'TXT files (*.txt)'}, ...
sprintf('Save ''%s'' as:', varName), ...
varName);
if ~isequal(fname, 0) && ~isequal(pname, 0)
saveDatFcn(pname, fname, handles.savedVars.(varName))
end
case 'Rename' % rename the variable in the base workspace
answer = inputdlg({sprintf('Rename ''%s'' as:', varName)}, ...
'Rename...', 1, {varName});
if ~isempty(answer) && ~strcmp(varName, answer{1})
if ~(evalin('base', sprintf('exist(''%s'', ''var'')', answer{1}))) && ...
isempty(strmatch(answer{1}, vars, 'exact'))
newVarNames = vars;
newVarNames{listboxVal} = answer{1};
for id = 1:length(vars)
tmp.(newVarNames{id}) = handles.savedVars.(vars{id});
end
handles.savedVars = tmp;
showAllVarsFcn(handles);
set(handles.VariableList, 'value', listboxVal);
assignin('base', answer{1}, handles.savedVars.(answer{1}));
evalin('base', sprintf('clear %s;', varName));
else
errordlg('That name is already in use.');
return;
end
end
case 'Delete' % delete the variable from the base workspace
btn = questdlg(sprintf('Delete ''%s'' from the workspace?', varName), ...
'Delete from workspace...', 'Yes', 'No', 'No');
switch btn
case 'Yes'
handles.savedVars = rmfield(handles.savedVars, varName);
showAllVarsFcn(handles);
evalin('base', sprintf('clear %s;', varName));
case 'No'
end
end
guidata(obj, handles);
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
% saveDatFcn
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
function saveDatFcn(pname, fname, var)
% this function saves the variable to file
[p, fname, ext] = fileparts(fname);
switch lower(ext)
case '.mat'
eval(sprintf('%s = var;', fname));
save(fullfile(pname, [fname, ext]), fname, '-v6');
case '.txt'
eval(sprintf('%s = var;', fname));
save(fullfile(pname, [fname, ext]), fname, '-ascii', '-double', '-tabs');
otherwise
errordlg('Unknown extension.');
end
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
% selectVariableFcn
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
function selectVariableFcn(varargin)
% this callback is called when a variable is selected from the variable
% listbox. When the variable is clicked, it will plot the data in the
% Preview Box above. If the variable is double-clicked, it will be opened
% in the Array Editor. It also ensures that the variable in the base
% workspace is the same copy as the variable stored in the GRABIT
% workspace. This means that if you change the contents of a variable in
% the base workspace (via other functions), then it will allow you to
% update the variable in the GRABIT workspace.
obj = varargin{1};
handles = guidata(obj);
sType = get(handles.GrabitGUI, 'SelectionType');
switch sType
case {'normal', 'open'} % single or double click
vars = fieldnames(handles.savedVars);
if isempty(vars)
return;
end
listVal = get(obj, 'value');
varName = vars{listVal};
% check to see if the stored var is the same as the var in the
% base workspace
if evalin('base', sprintf('exist(''%s'', ''var'')', varName))
% the copy in the base workspace must be a n-by-2 DOUBLE array
if strcmp(class(evalin('base', varName)), 'double') && ...
ndims(evalin('base', varName)) == 2 && ...
size(evalin('base', varName), 2) == 2
if ~isequal(evalin('base', varName), handles.savedVars.(varName))
% may have been modified in the base workspace
btn = questdlg(sprintf('''%s'' may have been modified in the base workspace (e.g. Array Editor).\nUpdate the variable?', varName), ...
'Modified Variable', 'Update Base Workspace', 'Update Grabit', 'Neither', 'Update Grabit');
switch btn
case 'Update Base Workspace'
assignin('base', varName, handles.savedVars.(varName));
case 'Update Grabit'
handles.savedVars.(varName) = evalin('base', varName);
showAllVarsFcn(handles);
set(obj, 'value', listVal);
end
end
else
btn = questdlg(sprintf('''%s'' in the base workspace is different from the one in Grabit.\nUpdate the base workspace variable?', varName), ...
'Wrong Variable', 'Update Base Workspace', 'Leave Untouched', 'Update Base Workspace');
switch btn
case 'Update Base Workspace'
assignin('base', varName, handles.savedVars.(varName));
end
end
else % the variable does not exist in base workspace, so make a copy
assignin('base', varName, handles.savedVars.(varName));
end
switch sType
case 'normal' % single click
axes(handles.PreviewAxis);
set(handles.PreviewLine, ...
'xdata', handles.savedVars.(varName)(:, 1), ...
'ydata', handles.savedVars.(varName)(:, 2));
axis auto;
case 'open' % double click
try
openvar(varName);
catch
errordlg(lasterr);
end
end
end
guidata(obj, handles);
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
% loadImageFcn
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
function loadImageFcn(varargin)
% this function loads an image file
[obj, filename] = splitvar(varargin([1, 3]));
handles = guidata(obj);
if isempty(filename)
[fname, pathname] = uigetfile(...
{'*.bmp;*.jpg;*.jpeg;*.tif;*.tiff;*.gif;*.png', ...
'Image Files (*.bmp, *.jpg, *.jpeg, *.tif, *.tiff, *.gif, *.png)';
'*.bpm', 'BPM files (*.bpm)';
'*.jpg;*jpeg', 'JPG files (*.jpg, *.jpeg)';
'*.tif;*tiff', 'TIFF files (*.tif, *.tiff)';
'*.gif', 'GIF files (*.gif)';
'*.png', 'PNG files (*.png)';
'*.*', 'All files (*.*)'}, 'Select an image file');
if ischar(fname)
filename = fullfile(pathname, fname);
else
return;
end
end
set(handles.ImageFileLoc, 'string', filename);
try
%warning off;
[A, map] = imread(filename);
%warning on;
catch
errordlg(lasterr);
return;
end
if ndims(A) == 3 %some TIFF files have wrong size matrices.
if size(A, 3)>3
A = A(:, :, 1:3);
elseif size(A, 3)<3
errordlg('This is a weird image file...possibly a bad TIFF file...');
return;
end
end
% Need this so that image shows up when not called by a CALLBACK
set(0, 'ShowHiddenHandles', 'on');
cla(handles.PreviewAxis);
handles.PreviewLine = line(NaN, NaN, ...
'color' , 'blue', ...
'linestyle' , '-', ...
'marker' , '.', ...
'tag' , 'PreviewLine', ...
'parent' , handles.PreviewAxis);
axes(handles.ImageAxis);
cla(handles.ImageAxis);
NP = get(handles.GrabitGUI, 'nextplot'); % for compatibility with R14
if isempty(map)
imageInfo = imfinfo(filename);
if strcmpi(imageInfo.ColorType, 'grayscale')
colormap(gray(2^imageInfo.BitDepth));
end
else
colormap(map);
end
iH = image(A);
set(iH, 'HitTest', 'off', 'EraseMode', 'normal');
set(handles.ImageAxis, 'xtick', [], 'ytick', []);
axis equal;
set(handles.GrabitGUI, 'nextplot', NP);
set(handles.ImageAxis, ...
'drawmode' , 'fast', ...
'tag' , 'ImageAxis', ...
'handlevisibility', 'callback', ...
'buttondownfcn' , @winBtnDownFcn);
set(get(handles.ImageAxis, 'title'), ...
'string' , '', ...
'fontunits' , 'pixels', ...
'fontsize' , 24, ...
'color' , 'red');
handles.ImageLine = line(NaN, NaN, ...
'color' , 'red', ...
'linestyle' , 'none', ...
'marker' , '.', ...
'tag' , 'ImageLine', ...
'hittest' , 'off');
handles.CalibPtsH(:,1) = line(repmat(NaN, 2, 4), repmat(NaN, 2, 4));
handles.CalibPtsH(:,2) = line(repmat(NaN, 2, 4), repmat(NaN, 2, 4));
set(handles.CalibPtsH(:,1), ...
{'marker','color'}, {'o','r';'o','r';'o','b';'o','b'}, ...
'markersize' , 10, ...
'hittest' , 'off');
set(handles.CalibPtsH(:,2), ...
{'marker','color'}, {'+','r';'x','r';'+','b';'x','b'}, ...
'markersize' , 20, ...
'hittest' , 'off');
% initialize image data
handles.I = A;
handles.map = map;
handles.CalibVals = [];
handles.CalibPts = [NaN, NaN, NaN, NaN];
handles.CalibPtsIm = repmat(NaN, 4, 2);
handles.ImLimits = [get(handles.ImageAxis, 'xlim'); ...
get(handles.ImageAxis, 'ylim')];
set(handles.CalibrateImageBtn, ...
'string', 'Calibrate', ...
'enable', 'inactive', ...
'value' , 0);
set(handles.GrabPointsBtn, ...
'enable', 'off', ...
'value' , 0);
set(handles.ZoomStateBtn, ...
'enable', 'inactive', ...
'value' , 0);
zoom off;
set(0, 'ShowHiddenHandles', 'off');
guidata(obj, handles);
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
% calibrateImageFcn
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
function calibrateImageFcn(varargin)
% this function performs calibration of the image by prompting the user to
% select 4 points on the image as reference points.
obj = varargin{1};
handles = guidata(obj);
if isempty(handles.I)
set(obj, 'enable', 'off');
else
switch get(obj, 'value')
case 0 % start calibration
set(obj, 'value', 1, 'backgroundcolor', handles.bgcolor4);
handles.curPointer = 'custom';
handles.curPointerData.CData = handles.xoPointer;
handles.curPointerData.HotSpot = handles.xoPointerHotSpot;
set(handles.GrabitGUI, ...
'PointerShapeCData' , handles.curPointerData.CData, ...
'PointerShapeHotSpot' , handles.curPointerData.HotSpot, ...
'WindowButtonMotionFcn' , {@pointerFcn, handles, handles.curPointer});
set([handles.LoadImageBtn, ...
handles.SaveAs, ...
handles.Rename, ...
handles.Delete], ...
'enable', 'off');
set(handles.CalibPtsH, 'xdata', NaN, 'ydata', NaN);
handles.CalibVals = [];
handles.CalibPts = [NaN, NaN, NaN, NaN];
handles.CalibPtsIm = repmat(NaN, 4, 2);
set([handles.hXoValue, handles.hXmValue, ...
handles.hYoValue, handles.hYmValue], ...
'string', ' NaN');
% this is the first calibration point: X-Axis Origin
handles.curTitle = 'Click on the ORIGIN of x-axis';
set(get(handles.ImageAxis, 'title'), ...
'string', handles.curTitle);
% change state to CALIBRATION
handles.state = 'calibration';
case 1 % stop (prematurely) calibration
set(obj, ...
'value' , 0, ...
'backgroundcolor' , handles.bgcolor3, ...
'string' , 'Calibrate');
handles.curTitle = '';
set(get(handles.ImageAxis, 'title'), 'string', '');
handles.curPointer = 'arrow';
set(handles.GrabitGUI, ...
'WindowButtonMotionFcn' , {@pointerFcn, handles, handles.curPointer});
set([handles.LoadImageBtn, ...
handles.SaveAs, ...
handles.Rename, ...
handles.Delete], ...
'enable', 'on');
% calibration was prematurely stopped, so reset all values
set(handles.CalibPtsH, 'xdata', NaN, 'ydata', NaN);
handles.CalibVals = [];
handles.CalibPts = [NaN, NaN, NaN, NaN];
handles.CalibPtsIm = repmat(NaN, 4, 2);
set([handles.hXoValue, handles.hXmValue, ...
handles.hYoValue, handles.hYmValue], ...
'string', ' NaN');
set(handles.GrabPointsBtn, 'enable', 'off');
set(handles.CoordinateEdit, 'visible', 'off');
% change state to NORMAL
handles.state = 'normal';
end
end
guidata(obj, handles);
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
% grabPointsFcn
%--------------------------------------------------------------------------
%--------------------------------------------------------------------------
function grabPointsFcn(varargin)
% this function is used to extract data points by prompting the user to
% select points on the image.
obj = varargin{1};
handles = guidata(obj);
switch get(obj, 'value')
case 0 % initiate point grabbing
calib = handles.CalibVals;
axes(handles.ImageAxis);
set(handles.ImageAxis, ...