离开千夏后，甲与莫霍克等人在方舟内进行演习。
演习结束后，甲和蕾一同造访社长室，勳正在为引渡千夏同圣良谈判。
甲向圣良询问在ES之海听到的玛萨的对话。 圣良向甲介绍关于十九的遗产的连接者系统的情报，并声称连接者技术只能适用于某个特定的人，那个人正身处GOAT不可触及的地方。 圣良称将释放千夏，并希望甲随后带真参观虚拟都市，好让认真起来没人能阻止逃跑的真自愿留下。 甲离开时永二进入社长室，认为方舟和魔狼要有动作的甲拜托蕾监视其动向。
甲送别千夏后将真带到虚拟都市中的如月寮，受到菜叶与亚季的热烈欢迎。 真在看到自己曾经的宿舍睹物思人，想要回到真正世界见姐姐，含泪跑出房间。 在交谈中众人意识到真的电脑症变得更严重了。
为了安慰真，甲将真带到复原的学园。 真似乎忘记了灰色圣诞节当天自己在何处做什么。 真因为自己体验过的混乱的梦境坚信世界是虚拟的，但仍然希望过去与甲的回忆是真实的。 真在学园时对甲隐藏的爱意因电脑症传到甲心中。 但真的“发现世界的矛盾，从而将大家从梦中唤醒”的愿望使得两人的心之距离再次拉远。
感到无法让甲理解真实世界的存在的真以战斗用电子体的姿态逃离方舟虚拟都市。 甲追赶过去，发现神父已在迎接真。甲想要杀死神父却被真阻止。 恐慌的真脑海中的情报传到甲的脑海中，甲看到神父死亡会导致编译者增殖的幻觉。 神父听闻称虽然现在还没有到这一步，但愿按神的告诫行事。甲意识到真为何被多米尼恩视为巫女。
真说自己的所为是让噩梦终结所必须的事情。 甲希望真能清醒下来阻止编译者，但真称曾在告诫中看到过甲的身影，相信甲一定能够最终阻止多米尼恩。
甲最终没能阻止真的离去。