推荐一个适合单细胞初学者加入的团队

docs/2025-01/推荐一个适合单细胞初学者加入的团队.md

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+title: "推荐一个适合单细胞初学者加入的团队"
+date: 2025-01-17T03:21:08Z
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+推荐一个适合单细胞初学者加入的团队 by 单细胞天地
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+<div><section data-tool="mdnice编辑器" data-website="https://www.mdnice.com"><blockquote data-tool="mdnice编辑器"><span></span><p>已经有三五年没有做过公众号的年度汇总了，因为我们《单细胞天地》公众号成立于2017然后差不多在2018就坚持了日更，那个时候10x技术的单细胞转录组还没有开始大行其道。</p></blockquote><p data-tool="mdnice编辑器">我做单细胞转录组数据分析课程的时候，smart-seq2技术还跟10x平分秋色， bd单细胞技术都看不到出头之日因为它有点类似于传统的表达量芯片而且还是依赖于已知的基因panel组合。</p><ul data-tool="mdnice编辑器"><li><section>首先呢，smart-seq2技术依赖于C1这个仪器，每次都是96个细胞一起测序，每个细胞的测序量这个综述可能是写错了，应该是1M-10M为佳，不太可能是100-1000个M，最重要的是它可以覆盖到整个RNA分子的全长测序，每个细胞都是独立的测序，独立的fastq文件哦 。</section></li><li><section>然后呢，对于10X技术单细胞转录组呢，每次可以测好几千的细胞，每个细胞只需要5-10K的reads，而且仅仅是测RNA分子的一段即可，全部的细胞都混合在一起是一个fastq文件，虽然说有barcode可以区分，可以拆分成为不同细胞的表达量矩阵。</section></li></ul><p data-tool="mdnice编辑器">一晃眼啊，三五年就过去了。没想到现在10x单细胞转录组技术已经是由三四五万一个样品到现在低于1万的收费了，而且有了大量的国产单细胞技术。详见之前看到的测评汇总文章：<a href="https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzk0ODM4NDk5MQ==&amp;mid=2247483948&amp;idx=1&amp;sn=bd57f35934c8fcfd975b31cf0dbd6482&amp;scene=21#wechat_redirect" data-linktype="2">12家公司的单细胞测序平台，究竟谁更胜一筹？</a> , 大概有如下技术：</p><ul data-tool="mdnice编辑器"><li><section>华大智造-DNBelab C4便携式单细胞系统</section></li><li><section>新格元-Singleron Matrix单细胞测序文库构建系统</section></li><li><section>寻因生物-Seekone DD数字液滴仪</section></li><li><section>万乘基因-10K Genomics液滴微流控单细胞测序仪</section></li><li><section>达普生物-Galaxy星海单细胞测序建库仪</section></li><li><section>墨卓生物-MobiNova-100单细胞测序建库系统</section></li><li><section>百迈客-百创DG1000单细胞微液滴系统</section></li></ul><p data-tool="mdnice编辑器">在刚刚过去的2024我们差不多也是做到了一年365天不间断更新，447篇推文，在坚持日更的7年我们差不多有了接近2000多篇推文笔记，包括各种综述的翻译肿瘤，常规流程的一步步细节展示，新技术新研究的文献速递，以及数据分析细节的剖析。</p><p><img data-imgfileid="100043913" data-ratio="0.6869369369369369" data-s="300,640" data-src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/siaia0BDGJdjQlicn4iaiaibh7yZcB2MiaVXleTic7pUd83grAyCZRvIU23iadojZYN0ZXajQhPicibDHeS89iasoUR28dfKfw/640?wx_fmt=png&amp;from=appmsg" data-type="png" data-w="888" src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/siaia0BDGJdjQlicn4iaiaibh7yZcB2MiaVXleTic7pUd83grAyCZRvIU23iadojZYN0ZXajQhPicibDHeS89iasoUR28dfKfw/640?wx_fmt=png&amp;from=appmsg"></p><figure data-tool="mdnice编辑器"><figcaption>一年365天不间断更新，447篇推文</figcaption></figure><h3 data-tool="mdnice编辑器"><span></span><span>新年新气象（招募新成员）</span><span></span></h3><p data-tool="mdnice编辑器">既然2025到来了，是时候开放一下新成员招募，大家在我们《单细胞天地》公众号看到的推文都是不同的专栏作者整理和发布的，公众号仅仅是一个流量聚集地而已，目前有6.4万粉丝数量，在这个单细胞技术细分垂直领域肯定是当之无愧的第一名了。如果大家有想宣传的新技术新方法新研究，我们《单细胞天地》公众号平台肯定是首选啦。2025我们仍然是开放之年，欢迎任何形式的合作宣传。</p><p data-tool="mdnice编辑器">同时，也借这个机会招募新成员，大家可以首先翻一下我们过往的2024甚至更早之前的推文历史，了解一下我们的不同专栏作者的选题和写作方向和范围，看看能不能找到自己的定位来加入到我们《单细胞天地》公众号创作团队哈！</p><p data-tool="mdnice编辑器">可以是具体的某个领域的单细胞文献归纳整理：</p><pre data-tool="mdnice编辑器"><span></span><code>1.文献解读标准<br>首先必须要有，文章发表于，年份杂志，标题 这样的开头<br>2.然后是摘要<br>使用哪种单细胞转录组技术，测下多少个样品，多少个细胞重点发现是什么（细胞亚群，还是特殊通路）<br>3.正文5个重点<br>首先是样品，建库测序，RNA-seq上游分析概况<br>然后是质量控制情况，最后的表达矩阵是多少个基因多少个细胞<br>接着介绍作者是如何挑选重要的基因和降维<br>降维后的聚类以及对每个类的注释<br>类的下游分析(差异分析或者实验验证等)<br>4.总结一下<br>这个研究的发现了什么，意义是/<br></code></pre><p data-tool="mdnice编辑器">可以是单细胞新技术新方法代码的实战演练，也可以是单细胞新研究的复现，也可以是有github全套代码的文献的图表复现！</p><h3 data-tool="mdnice编辑器"><span></span><span>加入有喜！</span><span></span></h3><p data-tool="mdnice编辑器">因为我们《单细胞天地》公众号适合的是初学者加入，所以理论上我没办法给初学者任何形式的金钱报酬。因为你加入团队后如果每天耗费我五分钟左右，一个月30天就是接近3小时，按照我的劳务报酬来计算，我相当于花费了3000到5000在你身上。<strong>我能保证的是你的加入肯定是能让你按部就班的学到单细胞技术，如果你真的用心的完成了写作任务。未来的你肯定是会感激你现在的这个选择，相信我！</strong></p><section data-style-type="5" data-tools="新媒体排版" data-id="1322513"><section data-style-type="5" data-tools="新媒体排版" data-id="1322503"><p><span data-txtless="spin" data-txtlessp="120">◆ </span><span></span><span>◆ </span><span></span><span data-txtless="spin" data-txtlessp="-120">◆  <span data-txtless="spin" data-txtlessp="120">◆ </span><span>◆</span></span></p></section><p><strong><span>欢迎有理想的小伙伴加入</span></strong></p></section><section data-style-type="5" data-tools="新媒体排版" data-id="1207583"><section><section><section><img data-ratio="0.015625" data-type="jpeg" data-w="256" data-src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_jpg/cZNhZQ6j4wxHjYl4eIGfcicTibYjia6zsGRRdhbicpU4JybsCCJUv7flbo2brIeYaicUFca1a3J0Ka0YfO7er980C6w/640?wx_fmt=jpeg&amp;wxfrom=5&amp;wx_lazy=1&amp;wx_co=1&amp;tp=wxpic" data-imgfileid="100043914" src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_jpg/cZNhZQ6j4wxHjYl4eIGfcicTibYjia6zsGRRdhbicpU4JybsCCJUv7flbo2brIeYaicUFca1a3J0Ka0YfO7er980C6w/640?wx_fmt=jpeg&amp;wxfrom=5&amp;wx_lazy=1&amp;wx_co=1&amp;tp=wxpic"></section><section data-style-type="5" data-tools="新媒体排版" data-id="1206990"><section><section powered-by="KolEditor.us"><section><section><br></section></section></section></section></section></section></section></section><section><section><p><img data-copyright="0" data-cropselx1="0" data-cropselx2="156" data-cropsely1="0" data-cropsely2="157" data-imgfileid="100043915" data-ratio="1" data-s="300,640" data-src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/cZNhZQ6j4wxHjYl4eIGfcicTibYjia6zsGRjkiabnxow9Bkfe1Khktc76vicUjbrUSOkpoaa8jNdoGGYkicwj1FguxtQ/640?wx_fmt=png&amp;wxfrom=5&amp;wx_lazy=1&amp;wx_co=1&amp;tp=wxpic" data-type="png" data-w="500" src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/cZNhZQ6j4wxHjYl4eIGfcicTibYjia6zsGRjkiabnxow9Bkfe1Khktc76vicUjbrUSOkpoaa8jNdoGGYkicwj1FguxtQ/640?wx_fmt=png&amp;wxfrom=5&amp;wx_lazy=1&amp;wx_co=1&amp;tp=wxpic"></p></section><p><span><strong>（长按图片扫描二维码可添加JIMMY微信报名单细胞天地公众号）</strong></span></p><p><span><strong>（添加好友务必备注：工作单位/高校+真实姓名，有简历发过来是加分项！）<br></strong></span></p></section><h3 data-tool="mdnice编辑器"><span></span><span>其它福利</span><span></span></h3><p data-tool="mdnice编辑器">比如早在2021，一个小伙伴拿到单细胞天地编辑群的入门券，也坚持下来了，所以我介绍了一个工作给她！</p><ul data-tool="mdnice编辑器"><li><section><a href="https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&amp;mid=2247486613&amp;idx=1&amp;sn=d28cfc0477d4eb02e6f0845db1c4a54b&amp;scene=21#wechat_redirect" data-linktype="2">综述：高维单细胞RNA测序数据分析工具（上）</a></section></li><li><section><a href="https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&amp;mid=2247486639&amp;idx=1&amp;sn=bbda9fef9c8c3c087686bb53723e4d51&amp;scene=21#wechat_redirect" data-linktype="2">综述：高维单细胞RNA测序数据分析工具（中）</a></section></li><li><section><a href="https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&amp;mid=2247486656&amp;idx=1&amp;sn=39fccb1c5fbbce7b3a61904c06041665&amp;scene=21#wechat_redirect" data-linktype="2">综述：高维单细胞RNA测序数据分析工具（下）</a></section></li><li><section><a href="https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&amp;mid=2247489208&amp;idx=1&amp;sn=e56a68f5ecaf9d10f21f169317fa0497&amp;scene=21#wechat_redirect" data-linktype="2">为什么你画的Seurat包PCA图与别人的方向不一致1？</a></section></li><li><section><a href="https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&amp;mid=2247489208&amp;idx=2&amp;sn=180c52e17730695a1b691fa52ea24ca0&amp;scene=21#wechat_redirect" data-linktype="2">你以为我发现Seurat包PCA图与别人的方向不一致挖到C/C++就完了么？</a></section></li></ul><p data-tool="mdnice编辑器"><strong>如果你让我认识了你，我会尽可能的在非物质层面帮助你。君子之交淡如水</strong></p></section><p><br></p><p><mp-style-type data-value="3"></mp-style-type></p></div>  
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