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mhlee216/Gene_Clustering_Node2Vec

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Node Clustering of Gene Co-expression Network from Single-cell RNA Sequencing Using Node2Vec

Dataset

scRNA-seq data of the human malaria parasite Plasmodium falciparum

Network

Abstract

말라리아는 공중 보건 차원에서 굉장히 심각한 문제이다. 그 중 Plasmodium Falciparum의 경우 매년 수많은 아동 사망의 원인이 된다. 특정한 질병을 예방 및 근절하기 위해서는 생활사에 대한 유전적 수준에서의 이해는 절대적으로 필요하다. 일반적으로 유전자적 수준에서의 분석은 scRNA-seq을 통해 이루어진다. 본 논문에서는 Plasmodum Falciparum 종의 scRNA-seq 데이터에 대한 gene co-expression network 및 Protein-Protein inteaction network 분석을 수행한다. 네트워크 분석을 통해 우리는 Plasmodum Falciparum 종의 생물학적인 이해 및 해석을 위한 연구를 가속화 할 단서를 제공한다. 또한 주요 유전자와 각 기능을 분석하고 질병 치료 약물의 타겟으로 고려할 수 있는 주요 유전자를 제시하고자 한다.

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